莆田學院多數(shù)學院已經(jīng)搬遷至新校區(qū)了，外國語學院、數(shù)學與金融學院、工藝美術學院、管理學院、商學院、基礎教育學院也將全部搬遷至新校區(qū)。余下的環(huán)境與生物工程學院，

信息工程學院、機電工程學院、土木工程學院、臨床醫(yī)學院、藥學與醫(yī)學技術學院、護理學院、體育學院等工科以及醫(yī)學學院也將陸續(xù)搬遷至新校區(qū)。

目前莆田學院一共設有16個二級學院其中包括：莆田學院機電工程學院、莆田學院信息工程學院、莆田學院數(shù)學與金融學院、莆田學院環(huán)境與生物工程學院、莆田學院土木工程學院、莆田學院文化與傳播學院、莆田學院外國語學院、莆田學院工藝美術學院、莆田學院音樂學院、莆田學院體育學院、莆田學院管理學院、莆田學院商學院等。